হেরাক্লিতোসের জীবন ছিলো একাকী ও বিষন্নতার। তার এই একাকিত্বের পেছনের কারণ হিসেবে বলা হয় তিনি সাধারণ মানুষ ও তাদের জীবনপদ্ধতির উপর বিরক্ত ছিলেন। নিজ শহর ইফসোসের মানুষদের তিনি বোকা বলে সমালোচনা করতেন।